Q. 支給項目設定の詳細設定に表示されている「控除基礎」はどのようなときに選択するのでしょうか？

欠勤控除や遅刻早退控除は、控除基礎合計額や所定労働時間を使用して計算します。
控除基礎にどの項目が該当するかは支給項目設定より「控除基礎」にチェックをいれることで個別設定ができます。
就業規則（もしくは給与規程）と照らし合わせて設定をお願いいたします。

最後に、「支給項目設定」画面左下にある「保存する」ボタンを押下してください。

こちらにチェックをいれている支給項目の合計値が「控除基礎」として、下記のように設定をしている支給項目の計算式に利用されるようになります。